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En el ámbito de la Ecología, el análisis de hipótesis es generalmente una tarea compleja que requiere de conocimiento tanto biológico como de desarrollo de software. La incorporación de estos métodos se puede realizar en forma de librerías o paquetes de software las cuales permiten a cualquier usuario realizar análisis avanzados independientemente de sus capacidades en programación. Además, es fundamental destacar la puesta a disposición de estas herramientas en acceso abierto para la comunidad (software open source). Esto respalda las bases de la filosofía del Grupo de Trabajo en Ecoinformática de la AEET: desarrollar una ciencia colaborativa, abierta y reproducible.